本校每年均會頒發獎學金予操行良好及表現傑出的學生，以表嘉許。獲頒獎學金的學生包括：學業成績優異、具卓越的領導才能、熱心參與校內及校外服務、於音樂／體育／視覺藝術等範疇作出貢獻。
學術獎學金
學術獎學金將自動授予成績優異及操行良好的學生，詳情請參閱以下圖表：
| 學術獎學金 | 獲獎者 |
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初中(中一至中三)
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第一名至第五名：全額獎學金
第六名至第十名：半額獎學金
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高中(中四至中五)
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HKDSE課程
第一名至第五名：全額獎學金
第六名至第十名：半額獎學金
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中四IB銜接課程及中五IBDP課程
第一名及第二名：全額獎學金
第三名至第五名：半額獎學金
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入學獎學金之延續資格如下：獲取全額獎學金者成績需為級內首10%，獲取半額獎學金者成績需為級內首15%。
非學術獎學金
學校每年會頒發金、銀、銅和鐵獎學金給在音樂、體育、視覺藝術及特別才能方面表現出色的學生。獎學金將以固定金額減免的形式頒發，金獎學金為 40,000 元，銀獎學金為 20,000 元，銅獎學金為 8,000 元，鐵獎學金為 2,000 元。獲得非學術獎學金的學生必須每年重新申請。
截止日期
申請須於 2024 年 6 月4 日或之前於辦公時間內遞交。
其他獎學金
學術獎
- 馬田獎學金
- 李頌清獎學金
- 聖士提反書院舊生會獎學金
- 源錫藩獎學金
- 33年暨55年畢業班獎學金
- 聖士提反書院獎學金
- 家長教師會卓越成績獎
- 家長教師會最佳進步獎
- 梁貫成教授數學科獎學金
- 崔世昌數學科最佳進步獎
- 入學優異生
全人發展獎
- 全材傑出學生獎
- 巢坤霖獎 - 本年度初中全材傑出男生
- 莫幹生獎 - 本年度高中全材傑出男生
- 張玉瓊獎 - 本年度初中全材傑出女生
- 梁乃元獎 - 本年度高中全材傑出女生
- 模範生獎
- 羅懿舒創意獎學金
- 尤德爵士紀念基金獎
- 香港青年獎勵計劃
熱心服務獎
- 服務獎
- 余金水服務獎
- 范秀容紀念服務獎
- 首席學長獎
- 社會服務獎
體育及音樂獎
- 葉敬平盃
- 百周年紀念盃 - 全年典範運動員獎
- 百周年風琴培訓獎學金
- 百周年紀念盃 - 全年最傑出音樂才藝獎
- 傑出音樂獎、體育獎學金及視覺藝術獎學金